Hinako adalah seorang mahasiswa yang suka berselancar yang baru saja pindah ke kota kecil di tepi laut. Ketika kebakaran tiba-tiba terjadi di gedung apartemennya, dia diselamatkan oleh Minato, seorang pemadam kebakaran yang tampan, dan keduanya segera jatuh cinta. Saat mereka menjadi tidak terpisahkan, Minato kehilangan nyawanya karena kecelakaan di laut. Hinako sangat bingung sehingga dia bahkan tidak bisa lagi melihat lautan, tetapi suatu hari dia menyanyikan lagu yang mengingatkannya pada waktu mereka bersama, dan Minato muncul di air. Sejak saat itu, dia dapat memanggilnya di permukaan berair segera setelah dia menyanyikan lagu mereka, tetapi bisakah keduanya benar-benar tetap bersama selamanya? Dan apa alasan sebenarnya dari kemunculan Minato yang tiba-tiba?

Ninja dengan batas garis keturunan mulai menghilang di semua negara dan titik menyalahkan terhadap negara api. Atas perintah Tsunade, Kakashi dikorbankan untuk mencegah perang habis-habisan. Setelah mewarisi pesona yang ditinggalkan oleh Kakashi, Naruto bertarung melalui teman dan musuh untuk mencegah kematiannya sambil mengubah pikiran orang-orang yang telah mewarisi kehendak api.

Sekelompok ninja misterius membuat serangan mendadak pada Konohagakure, yang membutuhkan kerusakan besar. Mimpi buruk Perang Dunia Shinobi lain bisa menjadi kenyataan. Sasuke, yang masih nin hilang dari Konoha mencoba membunuh saudaranya, Itachi, muncul untuk kedua kalinya di depan Naruto di lokasi yang tidak diketahui untuk mencegah hal itu terjadi.

Setelah penangkapannya karena percobaan pembunuhan Raikage, pemimpin Kumogakure, serta membunuh Jōnin dari Kirigakure dan Iwagakure, Naruto dipenjara di Hōzukijou: Sebuah fasilitas penahanan kriminal yang dikenal sebagai Penjara Darah. Mui, penguasa kastil, menggunakan teknik pemenjaraan pamungkas untuk mencuri kekuasaan dari para tahanan, yang ketika Naruto mengetahui bahwa hidupnya telah menjadi sasaran. Maka dimulailah pertempuran untuk mengungkap kebenaran di balik pembunuhan misterius dan membuktikan bahwa Naruto tidak bersalah.